Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms