Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms