Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP4Q9UKK3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms