Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPA4Q9UI42 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms