Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHA6Q9UF33 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHA6Q9UF33 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHA6Q9UF33 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHA6Q9UF33 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA6Q9UF33 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms