Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XCL2Q9UBD3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms