Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIGD1BQ9P298 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms