Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AIPL1Q9NZN9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AIPL1Q9NZN9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AIPL1Q9NZN9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AIPL1Q9NZN9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms