Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM53CQ9NYF3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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FAM53CQ9NYF3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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FAM53CQ9NYF3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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FAM53CQ9NYF3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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FAM53CQ9NYF3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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FAM53CQ9NYF3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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FAM53CQ9NYF3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53CQ9NYF3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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