Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VNN3Q9NY84 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms