Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms