Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms