Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZCCHC17Q9NP64 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms