Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM38AQ9H6F2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM38AQ9H6F2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms