Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms