Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms