Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms