Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL3Q9BY60 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms