Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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