Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA3CQ99985 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3CQ99985 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms