Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX2Q99697 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms