Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3CQ99613 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms