Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMTK3Q96Q04 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMTK3Q96Q04 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms