Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR3Q96KR7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR3Q96KR7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms