Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP47Q96K76 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP47Q96K76 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms