Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCANQ96GW7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms