Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BICD1Q96G01 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms