Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF548Q8NEK5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF548Q8NEK5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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