Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BBOF1Q8ND07 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBOF1Q8ND07 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms