Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms