Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H1FOOQ8IZA3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms