Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms