Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC4Q7Z404 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms