Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.155e-7■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC0.94□□□□□ -2.261e-36■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 DCUN1D5-203ENST00000527260 808 ntTSL 50.66□□□□□ -2.35e-6■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 MAP4K3-212ENST00000495648 564 ntTSL 50.34□□□□□ -2.365e-8■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 MFSD8-261ENST00000642121 220 nt-0.26□□□□□ -2.451e-36■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 DNM2-208ENST00000587329 498 ntTSL 39.4□□□□□ -0.93e-10■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 PRDX6-202ENST00000460950 809 ntTSL 28.45□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 TAPT1-207ENST00000505603 1634 ntTSL 217.58■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 RGS3-209ENST00000460000 536 ntTSL 413.44□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 RGS3-228ENST00000496264 457 ntTSL 510.42□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 RGS3-227ENST00000496113 641 ntTSL 49.99□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 RGS3-217ENST00000470775 364 ntTSL 59.06□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 GET4-203ENST00000412734 873 ntTSL 212.96□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 MARF1-214ENST00000552553 5053 ntTSL 58.15□□□□□ -1.115e-10■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 MARF1-205ENST00000548025 5891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.165e-10■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.25e-10■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.355e-10■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.425e-10■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.111e-6■■■■■ 37.3
PRPF8Q6P2Q9 IFRD1-214ENST00000486688 567 ntTSL 43.65□□□□□ -1.836e-13■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 CCDC138-202ENST00000409529 2364 ntTSL 210.17□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.643e-8■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.763e-8■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 INO80-203ENST00000557849 599 ntTSL 57.7□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP17-216ENST00000575412 520 ntTSL 26.43□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 IRF3-214ENST00000596788 447 ntTSL 317.1■□□□□ 0.334e-20■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.134e-20■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 ATXN1-206ENST00000483591 892 ntTSL 1 (best)7.27□□□□□ -1.251e-10■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 IKBKB-213ENST00000519938 2403 ntTSL 213.25□□□□□ -0.294e-11■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 PLAA-207ENST00000523212 730 ntTSL 312.53□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 IKBKB-226ENST00000523018 373 ntTSL 26.39□□□□□ -1.394e-11■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 MYO7A-207ENST00000481328 5740 ntTSL 211.2□□□□□ -0.625e-8■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 MYO7A-204ENST00000458169 4616 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.915e-8■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.64■■□□□ 1.385e-13■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 SUZ12P1-201ENST00000497969 886 ntTSL 1 (best)21.29■■□□□ 15e-13■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.555e-13■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 218.43■□□□□ 0.545e-13■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 KATNBL1-210ENST00000560108 853 ntTSL 516.63■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 KATNBL1-206ENST00000559462 562 ntTSL 212.32□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 KATNBL1-203ENST00000557877 797 ntTSL 512.03□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 211.87□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 ACACA-229ENST00000613776 1372 ntTSL 29.71□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 GALNT2-202ENST00000485438 4030 ntTSL 59.06□□□□□ -0.962e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 GALNT2-204ENST00000492568 2766 ntTSL 28.2□□□□□ -1.12e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 SNX5-218ENST00000606570 3931 nt5.12□□□□□ -1.592e-16■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.494e-11■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.764e-11■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.952e-7■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.124e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.014e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 GLB1-210ENST00000461475 816 ntTSL 314.07□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 GLB1-218ENST00000497796 899 ntTSL 313.56□□□□□ -0.244e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.684e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 GLB1-212ENST00000467571 517 ntTSL 37.89□□□□□ -1.154e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 EIF4G2-207ENST00000525995 592 ntTSL 418.14■□□□□ 0.493e-18■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 PIKFYVE-206ENST00000443896 3282 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 SNX3-203ENST00000368979 1537 ntTSL 219.1■□□□□ 0.653e-11■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.63e-11■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-11■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.553e-11■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 MTHFD2-206ENST00000477455 696 ntTSL 35.97□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 BIRC6-208ENST00000470250 472 ntTSL 21.26□□□□□ -2.219e-8■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 ETV5-203ENST00000421809 554 ntTSL 217.58■□□□□ 0.411e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 ETV5-202ENST00000413301 573 ntTSL 46.09□□□□□ -1.431e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 ETV5-207ENST00000440773 574 ntTSL 45.23□□□□□ -1.571e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 ETV5-208ENST00000472868 238 ntTSL 50.11□□□□□ -2.391e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 DDX39B-211ENST00000449757 591 ntTSL 39.19□□□□□ -0.944e-8■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.433e-9■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.573e-45■■■■■ 37.2
PRPF8Q6P2Q9 PIAS1-207ENST00000567417 708 ntTSL 32.06□□□□□ -2.086e-8■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 PIAS1-204ENST00000563996 1168 ntTSL 51.42□□□□□ -2.186e-8■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 TAF1D-202ENST00000393259 547 ntTSL 3-0.07□□□□□ -2.421e-7■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 CDC45-206ENST00000438587 552 ntTSL 45.85□□□□□ -1.475e-13■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 SF1-219ENST00000496969 455 ntTSL 37.09□□□□□ -1.286e-15■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 MYBBP1A-204ENST00000571354 579 ntTSL 320.05■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-222ENST00000493919 1948 ntTSL 29.21□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-215ENST00000478531 1972 ntTSL 1 (best)5.88□□□□□ -1.473e-7■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 PTCD3-216ENST00000487043 1054 ntTSL 32.65□□□□□ -1.984e-7■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 PSMD1-204ENST00000431051 2506 ntTSL 1 (best)11.62□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 RUSC1-215ENST00000492536 1069 ntTSL 320.33■□□□□ 0.842e-11■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 RUSC1-207ENST00000467820 915 ntTSL 318.06■□□□□ 0.482e-11■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 RUSC1-208ENST00000468764 682 ntTSL 316.06■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 RUSC1-216ENST00000497930 1156 ntTSL 315.04■□□□□ -02e-11■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 RUSC1-213ENST00000489860 934 ntTSL 513.94□□□□□ -0.182e-11■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0100-210ENST00000580882 1582 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 37.1
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1746.4 ms