Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CLQ60I27 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms