Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GARNL3Q5VVW2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms