Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RSPH4AQ5TD94 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RSPH4AQ5TD94 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms