Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms