Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms