Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRDTQ58F21 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms