Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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