Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms