Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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