Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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