Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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