Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN1Q15223 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms