Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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RAB39AQ14964 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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RAB39AQ14964 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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RAB39AQ14964 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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RAB39AQ14964 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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RAB39AQ14964 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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RAB39AQ14964 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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RAB39AQ14964 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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