Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VGLL4Q14135 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms