Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRR1Q13601 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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