Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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